Masterarbeit – X-Chromosomen-Inaktivierung mit Nanopore-Sequenzierung
Themenbeschreibung
Das Medizinisch Genetische Zentrum ist eine Facharztpraxis und ein akkreditiertes Labor für Humangenetik in München. Das im Jahr 2000 gegründete MGZ gehört mit seinem 20-köpfigen Ärzteteam und mehr als 160 Mitarbeitern in Deutschland zu den führenden Versorgern im Bereich der medizinischen Humangenetik.
Wir suchen einen enthusiastischen Masterstudenten, der unser Forschungsteam im Bereich der Epigenetik und Genomik unterstützt.
In dem Projekt soll die Inaktivierung des X-Chromosoms (XCI) mit Hilfe der Oxford Nanopore-Sequenzierung (3rd generation sequencing technology) untersucht werden.
X-chromosomal bedingte genetische Störungen betreffen Frauen aufgrund ihres zweiten X-Chromosoms weniger stark, allerdings kann eine solche Störung, die durch eine variabel phänotypiche Ausprägung der XCI beeinflusst wird, insbesondere, wenn es zu einer Verschiebung der XCI kommt, sich auf die Schwere der Krankheit auswirken.
Eine genaue Messung der Verschiebung der XCI ist entscheidend für die Vorhersage der Schwere der Krankheit bzw. Krankheitsanfälligkeit, wenn eine präventive Behandlung möglich ist. In diesem Projekt wollen wir Sequenzvarianten und Methylierungsmuster quantifizieren, um die X-Chromosom-Krankheitsvarianten in Patienten zu charakterisieren.
Darüber hinaus soll ein Protokoll für das Multiplexing von Nanopore-Cas9-angereicherten Sequenzierungsläufen entwickelt werden, das eine Optimierung genomischer Studien verspricht. Dieser Teil des Projekts wird eine große Auswirkung auf die Forschungsgemeinschaft haben, da es einen effizienteren und kostengünstigeren Ansatz für die Sequenzierung bietet.
Ihre Aufgaben
DNA-Extraktion und Vorbereitung von Nanopore-Sequenzierungs-Libraries
Optimierung von Nanopore Cas9-Anreicherungsmultiplexing und adaptiven Probenahmeprotokollen Dokumentation der Experimente
MithilfebeiderAnalysevonLong-Read-Sequenzierungsdaten
Ihr Profil
Sie streben einen Master in Molekulargenetik, Biologie, Biomedizin, Biochemie oder einem verwandten Fachgebiet an
Praktische Erfahrung in der Molekularbiologie (DNA-Extraktion und Vorbereitung von DNA-Libraries bevorzugt)
Theoretische Kenntnisse der Genetik (Genomstruktur, Vererbungsarten)
Kenntnisse in der Verarbeitung und Analyse von Sequenzierdaten (Kartierung, Datenvisualisierung,
Interpretation) ist ein Plus, aber nicht erforderlich
FließendeDeutsch-undEnglisch-Kenntnissesindunerlässlichunderforderlich
Was wir bieten
Arbeiten mit den neuesten molekulargenetischen Techniken
Langfristiges Perspektive mit hohem Gestaltungsspielraum bei einem der führenden, inhabergeführten
Genetiklabore in Deutschland
Mitarbeit in einem innovativen und interdisziplinären Team
VerantwortungsvolleundabwechslungsreicheAufgaben
Zusätzliche Leistungen für Mitarbeiter, wie Kaffee und Tee, täglich frisches Obst und Säfte, Betriebsfeiern, Zuschuss zu Fitnessstudio, etc.
Interessiert? Nähere Details finden Sie unter www.mgz-muenchen.de.
Wir bitten um Ihre vollständigen Bewerbungsunterlagen mit Anschreiben, Lebenslauf, Angabe zum möglichen Eintrittstermin per E-Mail an: bewerbung@mgz-muenchen.de
Bitte beachten Sie, dass entsprechend der gesetzlichen Vorgaben ein Arbeitsvertrag mit dem MGZ als Arztpraxis nur mit nachgewiesenem Masernschutz möglich ist.
MGZ – Medizinisch Genetisches Zentrum • Bayerstraße 3 – 5 • D-80335 München • Tel. +49 89 309 08 86 – 0 • Fax +49 89 309 08 86 – 66 www.mgz-muenchen.de • info@mgz-muenchen.de • Partnerschaftsregisternummer PR 2184 – AG München
